Rektoratas yra rektoriaus vadovaujama kolegiali patariamoji institucija. Rektoratą sudaro rektorius, prorektoriai, Universiteto sekretorius, fakultetų dekanai, padalinių, tarp jų ir turinčių juridinio asmens teises, vadovai ir studentų atstovybės deleguotas narys.

Rektorato nariai

• Prof. Alvydas Pumputis – Universiteto rektorius
• Prof. Justinas Sigitas Pečkaitis – studijų prorektorius
• Prof. Vidmantas Egidijus Kurapka – mokslo prorektorius
• Vladas Brakauskas – infrastruktūros prorektorius
• Doc. dr. Saulius Spurga – Universiteto sekretorius
• Prof. Vitalija Rudzkienė – Ekonomikos fakulteto dekanė
• Dr. Saulius Norvaišas – Socialinės informatikos fakulteto dekanas
• Prof. Leta Dromantienė – Socialinės politikos fakulteto dekanė  
• Doc. dr. Gintaras Aleknonis – Strateginio valdymo ir politikos fakulteto dekanas
• Prof. Egidijus Jarašiūnas – Teisės fakulteto dekanas 
• Doc. dr. Tadas Sudnickas – Viešojo administravimo fakulteto dekanas
• Doc. dr. Saulius Greičius – Viešojo saugumo fakulteto dekanas
• Doc. dr. Alvydas Rimantas Pauliukevičius – Teismo medicinos instituto direktorius
• Audrius Petrošius – Studentų atstovybės prezidentas

• Rektorato informacija